Com o desenvolvimento do setup 3D é possível planejar até os casos mais difíceis. A empresa Blue Aligner oferece também o serviço de planejamento ortodôntico. Esse serviço é bastante útil em casos “border line”, onde fica a dúvida em qual a conduta mais coerente no caso:  extrações de dentes ou não, espaços para implantes, movimentos possíveis e stripping necessário para a finalização correta do caso.